4D-lable free蛋白組
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Label-free定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)因?yàn)槠洳僮骱?jiǎn)單、不依賴于昂貴的標(biāo)記試劑、單次實(shí)驗(yàn)不受樣品數(shù)限制等獨(dú)特優(yōu)勢(shì)而備受廣泛重視。但傳統(tǒng)的label-free技術(shù)由于受質(zhì)譜儀靈敏度和掃描速度等性能的限制,在不分級(jí)的情況下檢測(cè)深度往往無(wú)法達(dá)到科研要求。
4D-label free蛋白質(zhì)組學(xué)是基于timsTOF Pro離子淌度平臺(tái)的非標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù),通過(guò)數(shù)據(jù)依賴性采集-同步累積連續(xù)碎裂(ddaPASEF)掃描模式進(jìn)行差異定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析。該技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)label free蛋白質(zhì)組學(xué)的升級(jí),其核心是將數(shù)據(jù)依賴采集(DDA)與同步累積連續(xù)碎裂(PASEF)相結(jié)合,外加第四維度的離子淌度分離(基于肽段的碰撞截面積CCS)。由于4D label-free技術(shù)的定量信息比傳統(tǒng)label-free多了一維離子淌度信息,使得定量結(jié)果更準(zhǔn)確,定量可重現(xiàn)性更好;提高了離子利用率和準(zhǔn)確度,以更少上樣量、更快掃描速度,實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學(xué)在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。
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1. 4D技術(shù):采用布魯克的timsTOF Pro質(zhì)譜平臺(tái),與傳統(tǒng)label-free相比增加一維離子淌度信息,使定量結(jié)果更準(zhǔn)確、重現(xiàn)性更好;
2. 適用于微量樣本:離子利用率和準(zhǔn)確度提高適用于微量樣本,更好解決臨床樣本少的問(wèn)題;
3. 可用于不同物種間的“有無(wú)差異蛋白”比較;
4. 超高定量準(zhǔn)確度∶高通量,覆蓋度更深,更穩(wěn)定,定量更準(zhǔn)確,數(shù)據(jù)更可靠。
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?實(shí)驗(yàn)路線:

數(shù)據(jù)分析路線:

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植物農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機(jī)制、生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制、育種保護(hù)研究等;
基礎(chǔ)研究:各種物種的蛋白質(zhì)組草圖構(gòu)建、蛋白作用機(jī)制與特殊功能蛋白質(zhì)篩選;
臨床診斷:生物疾病標(biāo)志物研究、生物疾病發(fā)生過(guò)程分子機(jī)制、個(gè)性化治療、腫瘤相關(guān)研究、臨床微量樣本檢測(cè)(如:外泌體、FFPE石蠟切片、活檢穿刺組織等)等;
藥物靶點(diǎn):化學(xué)或生物藥物作用靶點(diǎn)研究、化學(xué)或生物藥物作用機(jī)理信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究、藥物應(yīng)答、基因敲除/過(guò)表達(dá)的蛋白表達(dá)譜分析、疾病生物標(biāo)志物與藥物作用靶點(diǎn)高通量分析等;
微生物領(lǐng)域:致病機(jī)理、耐藥機(jī)制、病原體與宿主相互作用研究、脅迫逆境生理研究等。
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具體的預(yù)處理及存儲(chǔ)運(yùn)輸方式,請(qǐng)咨詢技術(shù)支持與銷售工程師;所有樣品應(yīng)避免反復(fù)凍融。
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布魯克timsTOF Pro捕集離子淌度質(zhì)譜。
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